水运具有占地小、少污染、运量大的优势，加快发展水运，是实现交通可持续发展的优势所在，也是建设资源节约型、环境友好型社会的积极举措。

　　交通部提出，“十一五”期间，我国沿海港口将新增吞吐能力80%以上，适应度接近1∶1；大力发展内河水运，加快长江黄金水道建设。

　　――沿海港口发展目标：建设上海等国际航运中心；进一步完善沿海港口布局，建设集装箱、煤炭、进口油气和铁矿石中转运输系统，扩大港口吞吐能力；改善港口航道条件；港口集疏运体系建设取得明显进展等。

　　――内河水运发展目标：完成长江口深水航道整治三期工程，长江干线航道进入系统治理阶段，航行条件明显改善；京杭运河堵航明显缓解；基本建成珠江三角洲高等级航道网；长江三角洲高等级航道网建设全面展开；西江航运干线通过能力明显提高；航电结合、梯级开发建设取得重大进展；内河船型标准化取得突破性进展等。